Program Studi Profesi dokter berlangsung selama 4 (empat) semester yang merupakan praktek klinik (Clinical Practice) di wahana pendidikan klinik yaitu pada rumah sakit pendidikan utama, satelit dan jejaring, juga di Sasana Tresna Werdha Ria Pembangunan, Panti Werdha Kristen Hana, Sanatorium Dharmawangsa, Rumah Sakit Khusus Jiwa Dharmagraha dan berbagai puskesmas di wilayah Jakarta dan luar Jakarta.
Pada PSPD mahasiswa belajar dengan bertemu pasien riil. untuk melakukan anamnesa, pemeriksaan fisik, membuat diagnosa serta anjuran penatalaksanaan di bawah bimbingan dokter pendidik klinik.